O acervo documental do APB é a principal fonte para o estudo da História da Bahia, pois guarda e preserva documentos preciosos para a recuperação da memória histórica brasileira. Aberto à comunidade, o APB mantém o equivalente a mais de 20 quilômetros de documentos históricos, distribuídos em seções distintas.

Dentre esses, encontram-se preciosidades, tais como o documento mais antigo do acervo, que registra a doação da Ilha de Itaparica a D. Antonio de Athayde, Conde de Castanheira, feita pelo Governador Geral Thomé de Souza em 1552; os Autos da Devassa da Conjuração Baiana de 1798; os da Revolta dos Malês de 1835, bem como o primeiro número do Diário Oficial do Estado, de 30 de outubro de 1915.